正确答案 ：D

解析

由文段“这种观念历史久远、根深蒂固，直到19世纪末期，很多有学问的科学家还坚信不移。所以原子的大门一直在禁锢着”，可知这种观念是根深蒂固的，一直影响着后来的科学家，而这种观念指代的就是前文提到的原子是不可再分的最小微粒。对应选项，D项当选。 A、B、C三项均非最主要原因，排除。 故本题答案为D项。