正确答案 ：C

解析

A项：秦始皇统一中国后实行郡县制，错误。B项：行省制度是在元朝的时候开始实行的，错误。C项：雍正七年（1729），因用兵西北，以内阁在太和门外，恐漏泄机密，始于隆宗门内设置军机房，选内阁中谨密者入值缮写，以为处理紧急军务之用，辅佐皇帝处理政务。雍正十年（1732），改称“办理军机处”，简称“军机处”。设军机大臣、军机章京等，均为兼职。乾隆帝时期复设军机处，从此成为清朝的中枢权力机关，一直到清末。正确。D项：三公九卿制于秦朝，错误。