在西方医学关于人体生命的理论中，由于受到原子论的影响，主张人和生命现象是可以还原为基本原子单位，及其相互作用的物理、化学原理。因此，医学和科学家们希望通过对人体最细微处的观察，来认识生命现象和疾病的成因，从人体的组织、器官到细胞、再到细菌、微生物、病毒乃至更微观的基因层次，希望尽可能多地观察和了解到人体内部的微观物质世界。西医所使用的药品都来自实验室，是经过各种化学实验的方式所合成的化合物，并试用在小白鼠身上以检测疗效。因此，在治疗疾病过程中西药见效快，针对性高，但是其中蕴含了一定的副作用。
西医与中医最大的不同在于：中医的治疗的是人，无论机体哪里出现问题，中医都是对人体整个身体进行调理，在治疗别的疾病的同时还能随即将患者其他方面的疾病治好。而且不同的病人即使所患疾病大致相同，但由于个人身体状况不同，采用的治疗措施和药品就不同。而且，同一种疾病在不同的年龄不同的地区不同的季节处理方法也会不同，目的只有一个就是把人治好。而西医治疗的是人身上的病，哪里出问题就有针对性地治疗哪里，而且强调疾病的普遍性和标准性，同一种疾病不同的病人在治疗和用药上应该相同。比如，一个人因为烦心事失眠，西医是不去理会什么烦不烦心的事，只管服安眠药就好了。因此，西医对于疾病处能够快速见效，但并不如中医治疗彻底和深入。
但不管是中医还是西医，都是经过文化的洗礼和岁月的沉淀积累下的瑰宝。然而，中医却在西医的逐渐发展冲击下没落下来。新文化运动的兴起，大批的先进知识分子对西方学术思想的追捧，包括中医在内的传统文化惨遭一些偏激知识分子扼杀围剿，如陈独秀表示：“中医不知科学，既不解人身之构造，复不事药性之分析，菌毒传染，更无闻焉”; 鲁迅在《呐喊》自序中写道“中医不过是一种有意的或无意的骗子”。中医无法解释愈病之理，还常蒙着神秘的封建迷信面纱，西医在解剖学和科技发展的背景下，逐渐占据了主导地位。

无论是中医学还是西医学，没有任何一种医学可以解决所有疑难杂症。此时，一些“假中医”或是“准中医”却大张旗鼓地宣扬中医中药可以治疗某些疑难杂症，甚至承诺包治百病、无效退款，诸如胡万林创造的“芒硝神话”、张悟本创造的“绿豆神话”。民间流传的一些偏方、祖传秘方治疗某种疾病虽然有一定的疗效，却常被不良药商包装成神药，利用患者“病急乱投医”的心理严重误导民众。同时，随着近代工农业的发展，自然环境遭受严重破坏，野生动植物资源遭受大面积破坏。在野生中药资源匮乏的背景下，某些药材商仍奉行拜金主义。以常见的当归为例，国内市场基本买不到未经硫磺熏制过的当归。经硫黄熏制后的当归美观诱人，能卖高价，且不易生虫，保存时间久。医者，患者性命所托； 药者，患者性命所赖。药材的质量直接影响药性，且不论药品疗效如何，不正确的药材加工方法会加重病情，危害健康，甚至可能危及患者的生命。
虽说现在我国仍有很多的中医学院，也有很多的名老中医，但是古今中医教育的方法却差异甚大。建国以前的中医教育大都采用传统的师承制，即师傅带徒弟。师徒之间朝夕相伴，形同父子。由于长期耳濡目染，徒弟对师傅的医法绝技、用药特色、生活起居皆了如指掌，假以时日，徒弟便可替师应诊。如今的高等中医院校却强调学习掌握中西医两套本领，中医与西医的课程比例几乎对等，导致本科五年的中医教育时间相当有限。而很多传统文化尚缺的学生更喜欢相对直观的西医学，难以热爱以唯象思维、阴阳五行为理论体系的中医学。除基本的中医学理论外，学生还要疲于其他课程的学习应试，更是无暇专注于中医的学习。结果导致大学培养出来的中医学生无固定的老师和临床思维方式，无足够的临床经验更无深厚的传统文化功底。
对于中医，我们应该对其加强传承。当然，传承并不是单纯的封闭，因循守旧只能被这个社会所淘汰，所以，传承的同时要以包容的姿态，与时俱进，兼收并蓄，才能得以发展，发展才是最好的传承。