正确答案 ：C

解析

【解析】简单计算。
由表2可知：2020年淮河流域主要支流监测的101个断面所占比例及其比2019年所增加百分点，即变化最大的两个水质只需比较其比2019年增加多少百分点即可，13.9个百分点和-16.8个百分点最大，所以变化最大的两个水质是Ⅲ类和Ⅳ类。故2019年Ⅲ类所占比重为51.5%－13.9%＝37.6%，Ⅳ类所占比重为23.8%－（-16.8%）＝40.6%，所以比重相差40.6%－37.6%＝3%。故本题答案为C项。